Molecular factors associated with pathogenicity of Phytophthora cinnamomi

Fatores moleculares associados com a patogenicidade de Phytophthora cinnamomi

  • Darling Lourenço
  • Priscila Leon
  • Luís Santos
  • Altino Branco Choupina CIMO-Mountain Research Center, Department of Biology and Biotechnology, Agricultural College of Bragança, Polytechnic Institute of Bragança, Campus Santa Apolónia, 5301-855, Bragança, Portugal

Resumo

Phytophthora cinnamomi é um patógeno do solo que possui uma ampla gama de hospedeiros em diversos países de diferentes climas. Esse fungo é responsável pela doença da tinta do castanheiro europeu (Castanea sativa Miller) e conduz à morte da árvore. Portugal se destaca na produção do castanheiro europeu. Entretanto, entre 2002 e 2004, houve uma redução de 27.3% na área de distribuição dessa área devido ao P. cinnamomi. O objetivo deste trabalho foi identificar fatores moleculares possivelmente associados à patogenicidade do fungo através de sequências genômicas depositadas no NCBI utilizando ferramentas de bioinformática. O primeiro contig foi utilizado e as ORFs presentes nas sequências foram identificadas. Foi utilizado o smartBlast em busca de proteínas homólogas. A predição da localização celular das proteínas foi feita através de quatro ferramentas: SignalP 4.1, Cello v.2.5, LOCTree3, Euk-mPLoc 2.0. A caracterização dos domínios dos produtos foi realizada utilizando o PROSITE e a predição das estruturas foi realizada utilizando o servidor Phyre2. Foram encontradas 13 proteínas provavelmente associadas com a patogenicidade de P. cinnamomi e as suas propriedades relacionadas com a infecção foram analisadas in silico. Esses resultados são importantes uma vez que são uma primeira etapa na busca por fatores patogênicos.

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Publicado
2020-01-29
Secção
Geral