Molecular factors associated with pathogenicity of Phytophthora cinnamomi
Fatores moleculares associados com a patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
DOI:
https://doi.org/10.19084/rca.18577Resumo
Phytophthora cinnamomi é um patógeno do solo que possui uma ampla gama de hospedeiros em diversos países de diferentes climas. Esse fungo é responsável pela doença da tinta do castanheiro europeu (Castanea sativa Miller) e conduz à morte da árvore. Portugal se destaca na produção do castanheiro europeu. Entretanto, entre 2002 e 2004, houve uma redução de 27.3% na área de distribuição dessa área devido ao P. cinnamomi. O objetivo deste trabalho foi identificar fatores moleculares possivelmente associados à patogenicidade do fungo através de sequências genômicas depositadas no NCBI utilizando ferramentas de bioinformática. O primeiro contig foi utilizado e as ORFs presentes nas sequências foram identificadas. Foi utilizado o smartBlast em busca de proteínas homólogas. A predição da localização celular das proteínas foi feita através de quatro ferramentas: SignalP 4.1, Cello v.2.5, LOCTree3, Euk-mPLoc 2.0. A caracterização dos domínios dos produtos foi realizada utilizando o PROSITE e a predição das estruturas foi realizada utilizando o servidor Phyre2. Foram encontradas 13 proteínas provavelmente associadas com a patogenicidade de P. cinnamomi e as suas propriedades relacionadas com a infecção foram analisadas in silico. Esses resultados são importantes uma vez que são uma primeira etapa na busca por fatores patogênicos.
